Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc8Q9CYA6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc8Q9CYA6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms