Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChtopQ9CY57 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms