Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms