Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx47Q9CWX9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms