Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Pfdn1Q9CWM4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Pfdn1Q9CWM4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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