Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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MINDY3Q9CV28 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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