Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snw1Q9CSN1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Snw1Q9CSN1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms