Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms