Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
1700029P11RikQ9CQ68 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms