Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Chmp3Q9CQ10 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Chmp3Q9CQ10 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Chmp3Q9CQ10 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Chmp3Q9CQ10 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms