Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl17Q9CPR4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms