Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prss29Q99MS4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prss29Q99MS4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms