Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CalcbQ99MP3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms