Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp1b4Q99ME6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms