Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms