Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms