Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lysmd3Q99LE3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lysmd3Q99LE3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms