Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99KU6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99KU6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99KU6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99KU6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms