Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pacsin3Q99JB8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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