Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg5Q99J83 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atg5Q99J83 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms