Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ophn1Q99J31 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms