Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ctu1Q99J10 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms