Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgs1Q923W1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms