Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms