Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clip1Q922J3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clip1Q922J3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms