Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncbQ91ZZ3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncbQ91ZZ3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms