Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl3Q91YH5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms