Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms