Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx11Q91WL6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx11Q91WL6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx11Q91WL6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms