Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms