Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PpcsQ8VDG5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms