Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ApobrQ8VBT6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApobrQ8VBT6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms