Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf183Q8QZS5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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