Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pitrm1Q8K411 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pitrm1Q8K411 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms