Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot6Q8K3P5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot6Q8K3P5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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