Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Polr1eQ8K202 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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