Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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