Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Trpm6Q8CIR4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms