Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phc3Q8CHP6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms