Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx8Q8CFD4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Snx8Q8CFD4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Snx8Q8CFD4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Snx8Q8CFD4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Snx8Q8CFD4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx8Q8CFD4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Snx8Q8CFD4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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