Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Klf17Q8CFA7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Klf17Q8CFA7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Klf17Q8CFA7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Klf17Q8CFA7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Klf17Q8CFA7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf17Q8CFA7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms