Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.4□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdkl1Q8CEQ0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms