Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms