Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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