Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp27Q8CEG8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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