Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc63Q8CDV6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms