Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms