Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CD60 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CD60 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CD60 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CD60 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CD60 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8CD60 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8CD60 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8CD60 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CD60 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms