Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Samd4aQ8CBY1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd4aQ8CBY1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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