Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms